Храм в селе Воинка старинный. Строительство его начато в 1887 году. Освящен в 1892 г. В период повсеместной ликвидации православных храмов был закрыт. Во время Великой Отечественной войны там располагался военный госпиталь. В послевоенное время в здании работала школа, а затем — сельская поликлиника.
В 1999 г. здание храма было возвращено православной общине.
15 мая 2010 г. на храм были установлены купола.
23 мая 2010 г., в день Святой Троицы, Преосвященнейший Алипий, Епископ Джанкойский и Раздольненский, совершил чин освящения трех накупольных крестов для храма
Религиозная Организация «Православный Приход Святого Апостола Фомы С. Воинка Красноперекопского района Республики Крым Джанкойской Епархии» ИНН 9106011954 ОГРН 1169102052492 зарегистрировано 20.02.1998 по юридическому адресу 296033, республика Крым, Красноперекопский район, село Воинка,улица Ленина, дом 11-б. Статус организации: действующая. Руководителем является настоятель Немеш Василий Михайлович.
Основной вид деятельности — Деятельность религиозных организаций.
Организация состоит на учете в налоговом органе МЕЖРАЙОННАЯ ИНСПЕКЦИЯ ФЕДЕРАЛЬНОЙ НАЛОГОВОЙ СЛУЖБЫ № 2 ПО РЕСПУБЛИКЕ КРЫМ с 26 января 2016 г., присвоен КПП 910601001. Регистрационный номер в ПФР — 091009002518, ФСС — 910900098491091.
Информации об участии Религиозная Организация «Православный Приход Святого Апостола Фомы С. Воинка Красноперекопского района Республики Крым Джанкойской Епархии» в тендерах не найдено. Данных об участии организации в арбитражных делах нет.